Структурных подразделений нет.

Главным административным лицом является руководитель Беляева А.В., осуществляющая непосредственное руководство школой в соответствии с законодательством РФ и локальными актами и несущая персональную ответственность за принимаемые решения. Руководитель определяет структуру управления школой, должностные обязанности работников; координирует деятельность подчиненных. Коллегиальные органы управления отсутствуют.

Основной структурной единицей, функционирующей в образовательной организации, является учебная группа.

Учебные группы формируются по возрасту и уровню владения японским языком.

Количество учеников в группах каждого уровня варьируется от 3 до 8.